南广高铁经过广州南站的改造后，在广州南站共设有15个出站通道（3层）和25台自动扶梯（负一层至三层各10台）。 由于广州地铁7号线延长线在站内通过地下隧道穿过，因此从地铁出口到高铁站房需要步行一段距离。
如果乘客乘坐高铁，则在负二层进站；如果是乘动车，则在下两层均可进站。 在售票厅旁有一个自助的进站闸机，如果有交通联合卡的旅客可以直接刷该卡进出站。 需要注意的是，目前高铁和动车是分层的，高铁集中在二楼北面，动车集中在负一、负二层。
另外，在地铁站台上也设置了安检装置。
为了配合南站的新建及改建项目，广州市交通局组织建设了新广州火车站综合交通枢纽工程，即新建连接地铁和高铁路线的天桥，同时完善周边的路网。
闻人烁良优质答主从站场层下到站台层（下到检票口），在一层北面、南面中间部分，共32个检票口。
广州南站在一层大厅东西两侧以及东西进站口、站台层东西两端共设有6部升降直梯和24部自动扶梯，方便重点旅客进出各层。为落实平安站车路、金盾护你行专项行动，在一层大厅东西两侧设有警务室，当旅客在出行过程中如遇到困难需要帮助时，可向就近的公安民警寻求帮助。
广州南站开通运营以来，广州南站党委坚持党建引领，倾心打造“口述广州南站”主题党建品牌。打造“广州南站职工书屋”文化阵地。广州南站党委积极向广大党员职工征集学习书籍，为“职工书屋”添砖加瓦。2018年，“口述广州南站——党建+文化工程”荣获“第五届全国基层党建创新最佳案例”。2021年，广州南站党委被中共中央授予“全国先进基层党组织”称号。
